Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCN1BQ07699 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms