Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABPAQ06546 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms