Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EXOSC9Q06265 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms