Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GBE1Q04446 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms