Protein–RNA interactions for Protein: Q02539

HIST1H1A, Histone H1.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST1H1AQ02539 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HIST1H1AQ02539 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HIST1H1AQ02539 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HIST1H1AQ02539 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HIST1H1AQ02539 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HIST1H1AQ02539 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms