Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms