Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRCDQ00LT1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms