Protein–RNA interactions for Protein: Q00796

SORD, Sorbitol dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORDQ00796 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SORDQ00796 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SORDQ00796 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SORDQ00796 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SORDQ00796 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SORDQ00796 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SORDQ00796 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SORDQ00796 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SORDQ00796 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SORDQ00796 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SORDQ00796 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SORDQ00796 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORDQ00796 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORDQ00796 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORDQ00796 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORDQ00796 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORDQ00796 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORDQ00796 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORDQ00796 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORDQ00796 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORDQ00796 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORDQ00796 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORDQ00796 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SORDQ00796 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORDQ00796 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORDQ00796 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORDQ00796 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORDQ00796 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORDQ00796 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORDQ00796 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORDQ00796 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORDQ00796 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORDQ00796 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORDQ00796 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORDQ00796 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORDQ00796 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORDQ00796 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORDQ00796 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORDQ00796 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORDQ00796 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORDQ00796 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORDQ00796 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORDQ00796 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORDQ00796 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORDQ00796 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SORDQ00796 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SORDQ00796 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SORDQ00796 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SORDQ00796 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SORDQ00796 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SORDQ00796 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SORDQ00796 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SORDQ00796 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SORDQ00796 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SORDQ00796 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SORDQ00796 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SORDQ00796 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SORDQ00796 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SORDQ00796 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SORDQ00796 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SORDQ00796 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SORDQ00796 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SORDQ00796 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SORDQ00796 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SORDQ00796 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SORDQ00796 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SORDQ00796 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SORDQ00796 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SORDQ00796 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SORDQ00796 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SORDQ00796 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SORDQ00796 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SORDQ00796 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SORDQ00796 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SORDQ00796 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SORDQ00796 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SORDQ00796 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SORDQ00796 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SORDQ00796 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SORDQ00796 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SORDQ00796 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SORDQ00796 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SORDQ00796 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SORDQ00796 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SORDQ00796 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SORDQ00796 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SORDQ00796 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SORDQ00796 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SORDQ00796 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SORDQ00796 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SORDQ00796 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SORDQ00796 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SORDQ00796 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SORDQ00796 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SORDQ00796 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SORDQ00796 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SORDQ00796 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SORDQ00796 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SORDQ00796 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SORDQ00796 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms