Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GNB1P62873 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GNB1P62873 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNB1P62873 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GNB1P62873 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNB1P62873 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNB1P62873 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNB1P62873 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNB1P62873 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNB1P62873 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNB1P62873 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNB1P62873 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GNB1P62873 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNB1P62873 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNB1P62873 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNB1P62873 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNB1P62873 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNB1P62873 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNB1P62873 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNB1P62873 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GNB1P62873 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNB1P62873 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNB1P62873 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNB1P62873 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GNB1P62873 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNB1P62873 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNB1P62873 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNB1P62873 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNB1P62873 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNB1P62873 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNB1P62873 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNB1P62873 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNB1P62873 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNB1P62873 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNB1P62873 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNB1P62873 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNB1P62873 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNB1P62873 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNB1P62873 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNB1P62873 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNB1P62873 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNB1P62873 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNB1P62873 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNB1P62873 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNB1P62873 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNB1P62873 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNB1P62873 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNB1P62873 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNB1P62873 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GNB1P62873 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNB1P62873 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNB1P62873 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNB1P62873 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNB1P62873 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNB1P62873 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNB1P62873 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNB1P62873 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNB1P62873 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNB1P62873 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNB1P62873 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNB1P62873 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GNB1P62873 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GNB1P62873 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNB1P62873 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNB1P62873 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNB1P62873 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNB1P62873 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNB1P62873 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNB1P62873 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNB1P62873 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNB1P62873 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNB1P62873 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNB1P62873 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNB1P62873 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNB1P62873 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNB1P62873 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GNB1P62873 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB1P62873 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB1P62873 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB1P62873 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB1P62873 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB1P62873 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB1P62873 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB1P62873 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB1P62873 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB1P62873 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB1P62873 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB1P62873 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB1P62873 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB1P62873 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB1P62873 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB1P62873 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB1P62873 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB1P62873 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB1P62873 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB1P62873 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB1P62873 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB1P62873 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB1P62873 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GNB1P62873 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms