Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPS28P62857 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPS28P62857 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPS28P62857 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPS28P62857 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPS28P62857 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPS28P62857 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPS28P62857 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPS28P62857 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPS28P62857 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPS28P62857 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPS28P62857 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPS28P62857 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPS28P62857 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPS28P62857 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPS28P62857 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPS28P62857 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPS28P62857 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPS28P62857 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPS28P62857 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
RPS28P62857 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
RPS28P62857 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
RPS28P62857 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
RPS28P62857 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
RPS28P62857 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
RPS28P62857 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
RPS28P62857 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
RPS28P62857 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
RPS28P62857 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
RPS28P62857 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
RPS28P62857 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
RPS28P62857 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RPS28P62857 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RPS28P62857 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RPS28P62857 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RPS28P62857 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RPS28P62857 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RPS28P62857 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RPS28P62857 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RPS28P62857 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RPS28P62857 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RPS28P62857 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RPS28P62857 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RPS28P62857 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RPS28P62857 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RPS28P62857 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RPS28P62857 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RPS28P62857 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RPS28P62857 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RPS28P62857 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RPS28P62857 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RPS28P62857 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RPS28P62857 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RPS28P62857 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RPS28P62857 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RPS28P62857 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RPS28P62857 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RPS28P62857 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS28P62857 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS28P62857 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS28P62857 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS28P62857 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS28P62857 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS28P62857 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS28P62857 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS28P62857 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS28P62857 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS28P62857 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS28P62857 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS28P62857 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS28P62857 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS28P62857 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS28P62857 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS28P62857 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS28P62857 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS28P62857 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS28P62857 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS28P62857 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS28P62857 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS28P62857 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS28P62857 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS28P62857 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS28P62857 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS28P62857 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS28P62857 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS28P62857 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS28P62857 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS28P62857 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS28P62857 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS28P62857 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS28P62857 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS28P62857 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS28P62857 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS28P62857 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS28P62857 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS28P62857 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS28P62857 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS28P62857 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS28P62857 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS28P62857 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms