Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA9P57773 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA9P57773 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA9P57773 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA9P57773 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GJA9P57773 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GJA9P57773 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GJA9P57773 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GJA9P57773 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GJA9P57773 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA9P57773 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA9P57773 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA9P57773 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA9P57773 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA9P57773 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA9P57773 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA9P57773 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA9P57773 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA9P57773 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA9P57773 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GJA9P57773 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJA9P57773 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJA9P57773 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GJA9P57773 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJA9P57773 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJA9P57773 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GJA9P57773 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GJA9P57773 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJA9P57773 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJA9P57773 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GJA9P57773 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GJA9P57773 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GJA9P57773 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
GJA9P57773 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJA9P57773 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJA9P57773 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GJA9P57773 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA9P57773 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA9P57773 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA9P57773 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA9P57773 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA9P57773 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA9P57773 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA9P57773 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA9P57773 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA9P57773 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA9P57773 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA9P57773 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA9P57773 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA9P57773 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA9P57773 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA9P57773 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GJA9P57773 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJA9P57773 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJA9P57773 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJA9P57773 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GJA9P57773 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJA9P57773 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJA9P57773 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJA9P57773 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJA9P57773 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJA9P57773 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJA9P57773 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GJA9P57773 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJA9P57773 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJA9P57773 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GJA9P57773 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GJA9P57773 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GJA9P57773 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA9P57773 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA9P57773 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA9P57773 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA9P57773 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA9P57773 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA9P57773 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA9P57773 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA9P57773 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA9P57773 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA9P57773 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA9P57773 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA9P57773 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA9P57773 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA9P57773 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA9P57773 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA9P57773 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA9P57773 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA9P57773 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA9P57773 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA9P57773 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA9P57773 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA9P57773 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA9P57773 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA9P57773 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GJA9P57773 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJA9P57773 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJA9P57773 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJA9P57773 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJA9P57773 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJA9P57773 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJA9P57773 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms