Protein–RNA interactions for Protein: P57721

PCBP3, Poly(rC)-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP3P57721 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCBP3P57721 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PCBP3P57721 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PCBP3P57721 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PCBP3P57721 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PCBP3P57721 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PCBP3P57721 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PCBP3P57721 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PCBP3P57721 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PCBP3P57721 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCBP3P57721 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCBP3P57721 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCBP3P57721 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCBP3P57721 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCBP3P57721 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCBP3P57721 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCBP3P57721 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCBP3P57721 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCBP3P57721 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCBP3P57721 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCBP3P57721 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms