Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLK1P49759 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLK1P49759 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLK1P49759 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLK1P49759 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLK1P49759 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLK1P49759 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLK1P49759 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLK1P49759 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLK1P49759 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLK1P49759 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLK1P49759 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLK1P49759 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLK1P49759 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLK1P49759 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLK1P49759 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLK1P49759 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLK1P49759 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLK1P49759 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLK1P49759 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLK1P49759 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLK1P49759 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CLK1P49759 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CLK1P49759 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLK1P49759 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CLK1P49759 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLK1P49759 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CLK1P49759 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CLK1P49759 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CLK1P49759 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLK1P49759 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLK1P49759 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLK1P49759 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLK1P49759 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLK1P49759 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLK1P49759 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLK1P49759 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLK1P49759 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLK1P49759 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLK1P49759 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLK1P49759 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLK1P49759 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLK1P49759 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLK1P49759 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLK1P49759 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLK1P49759 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLK1P49759 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLK1P49759 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLK1P49759 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLK1P49759 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLK1P49759 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLK1P49759 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLK1P49759 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLK1P49759 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLK1P49759 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLK1P49759 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLK1P49759 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLK1P49759 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLK1P49759 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLK1P49759 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLK1P49759 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLK1P49759 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLK1P49759 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLK1P49759 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLK1P49759 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLK1P49759 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLK1P49759 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLK1P49759 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLK1P49759 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLK1P49759 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CLK1P49759 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLK1P49759 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLK1P49759 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLK1P49759 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLK1P49759 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLK1P49759 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLK1P49759 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLK1P49759 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLK1P49759 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLK1P49759 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLK1P49759 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLK1P49759 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLK1P49759 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLK1P49759 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLK1P49759 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLK1P49759 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CLK1P49759 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLK1P49759 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLK1P49759 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLK1P49759 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLK1P49759 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLK1P49759 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLK1P49759 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLK1P49759 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLK1P49759 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLK1P49759 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLK1P49759 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLK1P49759 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLK1P49759 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLK1P49759 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms