Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PITPNBP48739 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms