Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms