Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT9P35527 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT9P35527 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT9P35527 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KRT9P35527 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KRT9P35527 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KRT9P35527 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KRT9P35527 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KRT9P35527 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KRT9P35527 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KRT9P35527 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KRT9P35527 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT9P35527 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT9P35527 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT9P35527 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT9P35527 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT9P35527 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT9P35527 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT9P35527 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT9P35527 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT9P35527 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT9P35527 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT9P35527 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT9P35527 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT9P35527 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT9P35527 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT9P35527 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KRT9P35527 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT9P35527 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT9P35527 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT9P35527 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT9P35527 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT9P35527 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT9P35527 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT9P35527 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT9P35527 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT9P35527 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT9P35527 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT9P35527 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT9P35527 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT9P35527 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT9P35527 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT9P35527 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT9P35527 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT9P35527 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT9P35527 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT9P35527 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT9P35527 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT9P35527 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT9P35527 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT9P35527 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT9P35527 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT9P35527 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT9P35527 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT9P35527 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT9P35527 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KRT9P35527 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT9P35527 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT9P35527 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT9P35527 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT9P35527 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT9P35527 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT9P35527 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT9P35527 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT9P35527 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT9P35527 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT9P35527 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT9P35527 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT9P35527 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT9P35527 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT9P35527 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT9P35527 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT9P35527 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT9P35527 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT9P35527 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KRT9P35527 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT9P35527 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT9P35527 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT9P35527 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT9P35527 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT9P35527 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT9P35527 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT9P35527 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT9P35527 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT9P35527 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT9P35527 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT9P35527 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT9P35527 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT9P35527 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT9P35527 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT9P35527 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT9P35527 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT9P35527 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT9P35527 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT9P35527 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT9P35527 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT9P35527 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT9P35527 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT9P35527 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KRT9P35527 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms