Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA4P35212 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA4P35212 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA4P35212 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA4P35212 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA4P35212 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA4P35212 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA4P35212 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA4P35212 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA4P35212 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA4P35212 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA4P35212 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA4P35212 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA4P35212 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA4P35212 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA4P35212 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA4P35212 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA4P35212 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJA4P35212 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJA4P35212 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJA4P35212 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJA4P35212 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJA4P35212 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJA4P35212 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJA4P35212 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJA4P35212 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJA4P35212 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GJA4P35212 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJA4P35212 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJA4P35212 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJA4P35212 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJA4P35212 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJA4P35212 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJA4P35212 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJA4P35212 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJA4P35212 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJA4P35212 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJA4P35212 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJA4P35212 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJA4P35212 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJA4P35212 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJA4P35212 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJA4P35212 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJA4P35212 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJA4P35212 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJA4P35212 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJA4P35212 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJA4P35212 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJA4P35212 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJA4P35212 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJA4P35212 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJA4P35212 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJA4P35212 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJA4P35212 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJA4P35212 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJA4P35212 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GJA4P35212 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJA4P35212 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GJA4P35212 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJA4P35212 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJA4P35212 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GJA4P35212 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GJA4P35212 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GJA4P35212 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GJA4P35212 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GJA4P35212 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GJA4P35212 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJA4P35212 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJA4P35212 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJA4P35212 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GJA4P35212 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJA4P35212 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJA4P35212 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJA4P35212 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJA4P35212 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GJA4P35212 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJA4P35212 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJA4P35212 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJA4P35212 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJA4P35212 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJA4P35212 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJA4P35212 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJA4P35212 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GJA4P35212 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GJA4P35212 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GJA4P35212 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GJA4P35212 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GJA4P35212 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GJA4P35212 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GJA4P35212 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GJA4P35212 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GJA4P35212 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GJA4P35212 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GJA4P35212 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GJA4P35212 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GJA4P35212 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GJA4P35212 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GJA4P35212 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GJA4P35212 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GJA4P35212 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms