Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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CASQ1P31415 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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CASQ1P31415 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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CASQ1P31415 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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CASQ1P31415 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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CASQ1P31415 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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CASQ1P31415 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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CASQ1P31415 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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CASQ1P31415 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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CASQ1P31415 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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CASQ1P31415 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CASQ1P31415 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
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