Protein–RNA interactions for Protein: P30405

PPIF, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPIFP30405 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPIFP30405 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPIFP30405 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPIFP30405 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PPIFP30405 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPIFP30405 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPIFP30405 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPIFP30405 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPIFP30405 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPIFP30405 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPIFP30405 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPIFP30405 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPIFP30405 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPIFP30405 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPIFP30405 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPIFP30405 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPIFP30405 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPIFP30405 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPIFP30405 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPIFP30405 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPIFP30405 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPIFP30405 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPIFP30405 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPIFP30405 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPIFP30405 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PPIFP30405 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PPIFP30405 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPIFP30405 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPIFP30405 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPIFP30405 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPIFP30405 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPIFP30405 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPIFP30405 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPIFP30405 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPIFP30405 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPIFP30405 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPIFP30405 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPIFP30405 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPIFP30405 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPIFP30405 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPIFP30405 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPIFP30405 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPIFP30405 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPIFP30405 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPIFP30405 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPIFP30405 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPIFP30405 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPIFP30405 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPIFP30405 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPIFP30405 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPIFP30405 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPIFP30405 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPIFP30405 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPIFP30405 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPIFP30405 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PPIFP30405 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPIFP30405 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPIFP30405 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPIFP30405 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPIFP30405 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPIFP30405 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPIFP30405 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPIFP30405 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPIFP30405 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPIFP30405 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPIFP30405 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PPIFP30405 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PPIFP30405 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PPIFP30405 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PPIFP30405 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PPIFP30405 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PPIFP30405 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPIFP30405 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPIFP30405 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPIFP30405 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPIFP30405 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPIFP30405 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPIFP30405 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPIFP30405 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPIFP30405 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPIFP30405 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPIFP30405 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PPIFP30405 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPIFP30405 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPIFP30405 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPIFP30405 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPIFP30405 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PPIFP30405 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPIFP30405 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPIFP30405 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPIFP30405 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPIFP30405 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPIFP30405 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPIFP30405 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPIFP30405 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPIFP30405 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPIFP30405 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPIFP30405 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPIFP30405 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PPIFP30405 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms