Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PSMB9P28065 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PSMB9P28065 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms