Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2B4P23634 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2B4P23634 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms