Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms