Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERCC3P19447 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC3P19447 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms