Protein–RNA interactions for Protein: P18577

RHCE, Blood group Rh(CE) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHCEP18577 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHCEP18577 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHCEP18577 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHCEP18577 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHCEP18577 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHCEP18577 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RHCEP18577 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHCEP18577 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHCEP18577 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHCEP18577 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHCEP18577 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHCEP18577 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHCEP18577 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHCEP18577 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHCEP18577 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHCEP18577 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHCEP18577 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RHCEP18577 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RHCEP18577 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHCEP18577 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHCEP18577 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHCEP18577 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHCEP18577 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHCEP18577 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHCEP18577 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHCEP18577 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHCEP18577 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHCEP18577 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHCEP18577 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHCEP18577 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHCEP18577 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHCEP18577 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHCEP18577 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHCEP18577 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHCEP18577 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RHCEP18577 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHCEP18577 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHCEP18577 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHCEP18577 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHCEP18577 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHCEP18577 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHCEP18577 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHCEP18577 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHCEP18577 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHCEP18577 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RHCEP18577 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHCEP18577 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHCEP18577 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHCEP18577 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHCEP18577 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHCEP18577 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHCEP18577 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RHCEP18577 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHCEP18577 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHCEP18577 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHCEP18577 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHCEP18577 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHCEP18577 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHCEP18577 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHCEP18577 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHCEP18577 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHCEP18577 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHCEP18577 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHCEP18577 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHCEP18577 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHCEP18577 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHCEP18577 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHCEP18577 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RHCEP18577 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHCEP18577 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHCEP18577 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHCEP18577 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHCEP18577 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHCEP18577 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHCEP18577 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RHCEP18577 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHCEP18577 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHCEP18577 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHCEP18577 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHCEP18577 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHCEP18577 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHCEP18577 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHCEP18577 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHCEP18577 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHCEP18577 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHCEP18577 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHCEP18577 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHCEP18577 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHCEP18577 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHCEP18577 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHCEP18577 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHCEP18577 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHCEP18577 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHCEP18577 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHCEP18577 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHCEP18577 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHCEP18577 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHCEP18577 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHCEP18577 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RHCEP18577 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms