Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GTF2F2P13984 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GTF2F2P13984 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms