Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BMP3P12645 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BMP3P12645 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BMP3P12645 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BMP3P12645 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BMP3P12645 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BMP3P12645 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BMP3P12645 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BMP3P12645 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BMP3P12645 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BMP3P12645 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BMP3P12645 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BMP3P12645 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BMP3P12645 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BMP3P12645 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BMP3P12645 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BMP3P12645 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BMP3P12645 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BMP3P12645 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BMP3P12645 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BMP3P12645 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BMP3P12645 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BMP3P12645 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BMP3P12645 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BMP3P12645 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BMP3P12645 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BMP3P12645 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BMP3P12645 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BMP3P12645 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BMP3P12645 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BMP3P12645 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BMP3P12645 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BMP3P12645 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BMP3P12645 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BMP3P12645 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BMP3P12645 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BMP3P12645 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BMP3P12645 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BMP3P12645 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BMP3P12645 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BMP3P12645 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BMP3P12645 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BMP3P12645 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BMP3P12645 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BMP3P12645 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BMP3P12645 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BMP3P12645 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BMP3P12645 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BMP3P12645 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BMP3P12645 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BMP3P12645 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BMP3P12645 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BMP3P12645 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BMP3P12645 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BMP3P12645 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BMP3P12645 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
BMP3P12645 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BMP3P12645 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BMP3P12645 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BMP3P12645 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BMP3P12645 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BMP3P12645 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BMP3P12645 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BMP3P12645 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BMP3P12645 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BMP3P12645 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BMP3P12645 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BMP3P12645 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BMP3P12645 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BMP3P12645 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BMP3P12645 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BMP3P12645 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BMP3P12645 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BMP3P12645 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BMP3P12645 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BMP3P12645 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BMP3P12645 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BMP3P12645 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BMP3P12645 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BMP3P12645 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BMP3P12645 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BMP3P12645 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BMP3P12645 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BMP3P12645 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BMP3P12645 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BMP3P12645 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BMP3P12645 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BMP3P12645 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BMP3P12645 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BMP3P12645 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BMP3P12645 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BMP3P12645 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BMP3P12645 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BMP3P12645 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BMP3P12645 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BMP3P12645 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BMP3P12645 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BMP3P12645 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BMP3P12645 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BMP3P12645 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms