Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RLBP1P12271 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RLBP1P12271 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms