Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRAPPC2BP0DI82 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms