Protein–RNA interactions for Protein: P09661

SNRPA1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPA1P09661 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SNRPA1P09661 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms