Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CENPBP07199 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CENPBP07199 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CENPBP07199 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CENPBP07199 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CENPBP07199 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CENPBP07199 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CENPBP07199 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CENPBP07199 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CENPBP07199 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CENPBP07199 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CENPBP07199 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CENPBP07199 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CENPBP07199 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CENPBP07199 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CENPBP07199 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CENPBP07199 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CENPBP07199 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CENPBP07199 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CENPBP07199 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CENPBP07199 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CENPBP07199 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CENPBP07199 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CENPBP07199 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CENPBP07199 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CENPBP07199 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CENPBP07199 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CENPBP07199 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CENPBP07199 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CENPBP07199 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CENPBP07199 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CENPBP07199 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CENPBP07199 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CENPBP07199 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CENPBP07199 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CENPBP07199 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CENPBP07199 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CENPBP07199 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CENPBP07199 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CENPBP07199 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CENPBP07199 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CENPBP07199 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CENPBP07199 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CENPBP07199 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CENPBP07199 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CENPBP07199 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CENPBP07199 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CENPBP07199 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CENPBP07199 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CENPBP07199 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CENPBP07199 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CENPBP07199 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CENPBP07199 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CENPBP07199 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CENPBP07199 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CENPBP07199 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CENPBP07199 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CENPBP07199 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CENPBP07199 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CENPBP07199 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.92
CENPBP07199 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CENPBP07199 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CENPBP07199 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CENPBP07199 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CENPBP07199 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CENPBP07199 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CENPBP07199 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CENPBP07199 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CENPBP07199 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CENPBP07199 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CENPBP07199 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CENPBP07199 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CENPBP07199 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CENPBP07199 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CENPBP07199 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CENPBP07199 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CENPBP07199 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CENPBP07199 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CENPBP07199 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CENPBP07199 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CENPBP07199 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CENPBP07199 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CENPBP07199 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CENPBP07199 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CENPBP07199 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CENPBP07199 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CENPBP07199 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CENPBP07199 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CENPBP07199 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CENPBP07199 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CENPBP07199 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CENPBP07199 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CENPBP07199 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CENPBP07199 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CENPBP07199 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CENPBP07199 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CENPBP07199 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CENPBP07199 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CENPBP07199 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CENPBP07199 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms