Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CYBBP04839 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CYBBP04839 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYBBP04839 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYBBP04839 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYBBP04839 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYBBP04839 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYBBP04839 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYBBP04839 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYBBP04839 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYBBP04839 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CYBBP04839 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYBBP04839 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYBBP04839 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYBBP04839 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYBBP04839 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYBBP04839 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYBBP04839 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYBBP04839 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYBBP04839 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYBBP04839 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYBBP04839 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYBBP04839 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYBBP04839 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYBBP04839 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYBBP04839 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYBBP04839 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYBBP04839 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYBBP04839 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYBBP04839 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYBBP04839 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYBBP04839 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYBBP04839 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYBBP04839 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYBBP04839 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYBBP04839 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYBBP04839 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYBBP04839 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYBBP04839 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CYBBP04839 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CYBBP04839 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CYBBP04839 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CYBBP04839 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYBBP04839 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYBBP04839 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYBBP04839 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYBBP04839 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYBBP04839 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYBBP04839 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYBBP04839 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYBBP04839 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYBBP04839 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYBBP04839 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYBBP04839 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYBBP04839 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYBBP04839 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYBBP04839 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYBBP04839 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYBBP04839 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CYBBP04839 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYBBP04839 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYBBP04839 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYBBP04839 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYBBP04839 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYBBP04839 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYBBP04839 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYBBP04839 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYBBP04839 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYBBP04839 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CYBBP04839 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYBBP04839 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYBBP04839 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYBBP04839 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYBBP04839 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYBBP04839 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYBBP04839 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYBBP04839 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYBBP04839 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYBBP04839 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYBBP04839 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CYBBP04839 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYBBP04839 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYBBP04839 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYBBP04839 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYBBP04839 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYBBP04839 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYBBP04839 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYBBP04839 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CYBBP04839 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYBBP04839 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYBBP04839 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYBBP04839 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYBBP04839 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYBBP04839 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYBBP04839 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYBBP04839 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYBBP04839 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYBBP04839 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYBBP04839 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYBBP04839 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms