Protein–RNA interactions for Protein: O75380

NDUFS6, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS6O75380 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDUFS6O75380 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms