Protein–RNA interactions for Protein: O75167

PHACTR2, Phosphatase and actin regulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR2O75167 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHACTR2O75167 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHACTR2O75167 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHACTR2O75167 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHACTR2O75167 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHACTR2O75167 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHACTR2O75167 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHACTR2O75167 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHACTR2O75167 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHACTR2O75167 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHACTR2O75167 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHACTR2O75167 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHACTR2O75167 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHACTR2O75167 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHACTR2O75167 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PHACTR2O75167 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHACTR2O75167 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms