Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NBNO60934 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NBNO60934 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NBNO60934 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NBNO60934 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NBNO60934 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NBNO60934 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NBNO60934 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NBNO60934 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NBNO60934 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NBNO60934 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NBNO60934 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NBNO60934 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NBNO60934 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NBNO60934 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NBNO60934 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NBNO60934 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NBNO60934 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NBNO60934 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NBNO60934 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NBNO60934 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NBNO60934 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NBNO60934 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NBNO60934 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NBNO60934 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NBNO60934 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NBNO60934 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NBNO60934 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NBNO60934 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NBNO60934 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NBNO60934 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NBNO60934 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NBNO60934 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NBNO60934 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NBNO60934 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NBNO60934 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NBNO60934 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NBNO60934 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NBNO60934 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NBNO60934 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NBNO60934 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NBNO60934 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NBNO60934 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NBNO60934 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NBNO60934 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NBNO60934 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NBNO60934 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NBNO60934 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NBNO60934 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NBNO60934 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NBNO60934 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NBNO60934 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NBNO60934 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NBNO60934 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NBNO60934 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NBNO60934 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NBNO60934 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NBNO60934 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NBNO60934 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NBNO60934 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NBNO60934 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NBNO60934 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NBNO60934 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NBNO60934 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NBNO60934 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NBNO60934 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NBNO60934 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NBNO60934 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NBNO60934 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NBNO60934 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NBNO60934 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NBNO60934 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NBNO60934 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NBNO60934 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NBNO60934 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NBNO60934 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NBNO60934 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NBNO60934 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NBNO60934 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NBNO60934 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NBNO60934 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NBNO60934 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NBNO60934 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NBNO60934 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NBNO60934 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NBNO60934 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NBNO60934 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NBNO60934 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NBNO60934 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NBNO60934 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NBNO60934 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NBNO60934 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NBNO60934 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NBNO60934 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NBNO60934 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NBNO60934 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NBNO60934 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NBNO60934 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NBNO60934 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NBNO60934 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms