Protein–RNA interactions for Protein: J3QR89

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QR89 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QR89 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QR89 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QR89 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QR89 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QR89 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QR89 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QR89 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QR89 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QR89 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QR89 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QR89 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QR89 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QR89 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QR89 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QR89 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QR89 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QR89 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QR89 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QR89 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QR89 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QR89 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QR89 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QR89 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QR89 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QR89 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QR89 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QR89 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QR89 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QR89 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QR89 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QR89 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QR89 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QR89 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QR89 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QR89 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
J3QR89 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QR89 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QR89 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QR89 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QR89 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QR89 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QR89 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QR89 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QR89 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QR89 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QR89 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QR89 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QR89 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QR89 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QR89 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QR89 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QR89 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QR89 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QR89 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QR89 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QR89 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QR89 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QR89 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QR89 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QR89 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QR89 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QR89 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QR89 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QR89 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QR89 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QR89 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QR89 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QR89 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QR89 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QR89 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QR89 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QR89 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
J3QR89 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QR89 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QR89 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QR89 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QR89 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QR89 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QR89 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QR89 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QR89 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QR89 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QR89 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QR89 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QR89 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QR89 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QR89 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QR89 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QR89 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QR89 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QR89 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QR89 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QR89 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QR89 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QR89 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QR89 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QR89 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QR89 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
J3QR89 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms