Protein–RNA interactions for Protein: B1ANY3

FAM220BP, Putative protein FAM220BP, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM220BPB1ANY3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM220BPB1ANY3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms