Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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LINC00587B1AMM8 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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LINC00587B1AMM8 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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LINC00587B1AMM8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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LINC00587B1AMM8 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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LINC00587B1AMM8 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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LINC00587B1AMM8 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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LINC00587B1AMM8 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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LINC00587B1AMM8 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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LINC00587B1AMM8 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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LINC00587B1AMM8 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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LINC00587B1AMM8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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LINC00587B1AMM8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LINC00587B1AMM8 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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