Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LINC00862A6NCI5 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms