Protein–RNA interactions for Protein: A0JP26

POTEB3, POTE ankyrin domain family member B3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEB3A0JP26 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POTEB3A0JP26 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms