Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1G8

TRBV10-2, T-cell receptor beta variable 10-2 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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TRBV10-2A0A0K0K1G8 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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TRBV10-2A0A0K0K1G8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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TRBV10-2A0A0K0K1G8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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