Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 ZNF407-207ENST00000582337 5662 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 GDF9-202ENST00000378673 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 CEBPZOS-204ENST00000402297 3158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 CACNB4-254ENST00000637514 1880 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 PLXDC2-203ENST00000377252 12468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 DLG2-209ENST00000418306 3027 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 AC020978.8-201ENST00000571975 3022 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 ACO1-201ENST00000309951 7466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 ZNF397-202ENST00000330501 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 KCNMA1-273ENST00000639913 12071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 SENP8-201ENST00000340912 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 CCP110-202ENST00000396208 5151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 AF131215.2-201ENST00000531549 1710 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 SPHKAP-202ENST00000392056 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 SUPT6H-201ENST00000314616 6523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 NCAPH-205ENST00000455200 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 LINC01931-201ENST00000295052 1832 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 IRF6-201ENST00000367021 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 STAMBPL1-201ENST00000371922 1899 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 RRP8-201ENST00000254605 6560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
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PTPRMP28827 AC004039.1-201ENST00000431165 502 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
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PTPRMP28827 CBFA2T2-203ENST00000346541 7737 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
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PTPRMP28827 CHD8-213ENST00000557364 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 ZSWIM5P3-201ENST00000511265 2743 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 AC099062.1-202ENST00000640362 3864 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
PTPRMP28827 HSD17B13-202ENST00000328546 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
PTPRMP28827 MAPK10-251ENST00000640858 3052 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
PTPRMP28827 LINC00261-202ENST00000564492 4912 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
PTPRMP28827 LRBA-204ENST00000507224 8826 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
PTPRMP28827 MEGF10-203ENST00000503335 7571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PTPRMP28827 ZCCHC11-201ENST00000257177 5743 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PTPRMP28827 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PTPRMP28827 SOX9-AS1-202ENST00000414600 742 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
PTPRMP28827 AL162427.1-201ENST00000450399 439 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
PTPRMP28827 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
PTPRMP28827 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
PTPRMP28827 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
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