Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AL139041.1-201ENST00000605480 610 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 RNASE11-211ENST00000620912 883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AL035425.4-201ENST00000624509 1063 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 TLR1-201ENST00000308979 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 CX3CR1-202ENST00000399220 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 ZNF131-201ENST00000306938 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 ATAD1-202ENST00000328142 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AF064860.2-201ENST00000457325 1542 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AC007485.2-201ENST00000623493 1667 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 OR11H13P-201ENST00000359695 979 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 RNA5SP321-201ENST00000362722 111 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 RANP6-201ENST00000413691 644 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AC084816.1-201ENST00000413794 565 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 LINC01497-201ENST00000420427 665 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AL358394.1-201ENST00000422807 535 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 RPL6-202ENST00000424576 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 BRWD1-IT1-201ENST00000435608 489 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 GTF2IP14-201ENST00000441415 586 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 RARRES2P3-201ENST00000457739 473 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 MGAT4D-201ENST00000503109 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AC091849.1-201ENST00000509920 121 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AC022973.4-201ENST00000524100 917 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AC135983.3-201ENST00000528049 1226 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 PSMA6-214ENST00000556506 763 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 TRIM69-208ENST00000560442 1262 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 RN7SL404P-201ENST00000582421 281 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AC008543.3-201ENST00000586983 491 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AC073539.3-201ENST00000601905 386 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AL035410.2-201ENST00000604963 864 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AC114477.1-201ENST00000605097 605 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AC004908.1-201ENST00000606572 541 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 CYP4A22-206ENST00000619754 2351 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 CDH12-208ENST00000522262 3028 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 IGKV3-7-201ENST00000390247 445 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 MRPS21P5-201ENST00000417885 231 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 LINC00433-201ENST00000424165 888 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LRRTM2O43300 OR13C7-201ENST00000424348 959 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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