Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 CHMP1B-AS1-201ENST00000586474 553 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF730-201ENST00000593635 464 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 AC091133.5-201ENST00000603088 301 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 OR5D13-201ENST00000623930 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 AC019270.1-201ENST00000523495 3488 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 ZFX-204ENST00000379188 7513 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 HLTF-201ENST00000310053 5317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 AC097478.1-207ENST00000612706 2422 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 OR5T2-202ENST00000641661 2062 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 KLHL7-203ENST00000409689 3231 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 BVES-AS1-202ENST00000369122 1716 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 GON4L-201ENST00000271883 7138 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 MAGEB10-202ENST00000614159 1389 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF100-202ENST00000358296 5745 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 MORF4L2-208ENST00000441076 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 HTR4-206ENST00000520086 2272 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 GRIK1-202ENST00000389124 2712 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 ADGRL3-206ENST00000507164 4982 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 ENSA-201ENST00000271690 2818 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM138-209ENST00000542946 2839 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM13A-201ENST00000264344 5858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 KIDINS220-206ENST00000473731 7248 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 RYBP-201ENST00000477973 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 RNF14-204ENST00000394519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 FOPNL-206ENST00000573968 2039 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 CCDC102B-210ENST00000584156 1554 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 LRRC37B-203ENST00000394713 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 ASH1L-202ENST00000392403 10979 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 DLG1-202ENST00000357674 4931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 LTBP1-201ENST00000402934 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 ABCA11P-202ENST00000504019 2110 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 PIGN-221ENST00000638183 4046 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 MLIP-206ENST00000502396 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 ZMYND8-206ENST00000372023 5144 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 AADACL3-201ENST00000359318 3662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 IL1RAP-201ENST00000072516 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 HNRNPU-223ENST00000640001 4227 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 CSNK1A1-204ENST00000504676 1772 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 ZBTB18-201ENST00000358704 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 NEK1-208ENST00000512193 4430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 YIPF4-201ENST00000238831 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 LDHA-206ENST00000430553 1310 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 CXCR4-202ENST00000409817 1895 ntAPPRIS P3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF559-ZNF177-203ENST00000541595 2435 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 SORBS1-211ENST00000371247 7354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 A2ML1-201ENST00000299698 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 CTNND1-234ENST00000532844 6012 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 CLASP1-208ENST00000455322 5660 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 FOCAD-201ENST00000338382 5765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 MYH15-201ENST00000273353 7074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 MXI1-203ENST00000361248 2188 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 FOXJ3-205ENST00000372573 5309 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC14A1-208ENST00000586142 2846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 DOCK11-201ENST00000276202 6625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 ZMYND8-207ENST00000396281 5511 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 AC079949.2-201ENST00000617117 2933 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 STOM-201ENST00000286713 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 SRCAP-201ENST00000262518 11754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 MID1-201ENST00000317552 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 DPY19L3-205ENST00000586987 5925 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF397-202ENST00000330501 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 MFSD6-201ENST00000281416 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 CR1-206ENST00000400960 6959 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 COL21A1-203ENST00000370819 4094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 NUP155-207ENST00000513532 4088 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 ADAL-203ENST00000428046 3514 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 KALRN-202ENST00000291478 10888 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP2-4Q9BYR9 KAT14-202ENST00000435364 3618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.6 ms