Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAMTA1Q9Y6Y1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAMTA1Q9Y6Y1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAMTA1Q9Y6Y1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAMTA1Q9Y6Y1 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAMTA1Q9Y6Y1 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAMTA1Q9Y6Y1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CAMTA1Q9Y6Y1 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAMTA1Q9Y6Y1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAMTA1Q9Y6Y1 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAMTA1Q9Y6Y1 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAMTA1Q9Y6Y1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAMTA1Q9Y6Y1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAMTA1Q9Y6Y1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAMTA1Q9Y6Y1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAMTA1Q9Y6Y1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CAMTA1Q9Y6Y1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAMTA1Q9Y6Y1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAMTA1Q9Y6Y1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAMTA1Q9Y6Y1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAMTA1Q9Y6Y1 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CAMTA1Q9Y6Y1 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAMTA1Q9Y6Y1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAMTA1Q9Y6Y1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAMTA1Q9Y6Y1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAMTA1Q9Y6Y1 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAMTA1Q9Y6Y1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAMTA1Q9Y6Y1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAMTA1Q9Y6Y1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAMTA1Q9Y6Y1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAMTA1Q9Y6Y1 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAMTA1Q9Y6Y1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAMTA1Q9Y6Y1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAMTA1Q9Y6Y1 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CAMTA1Q9Y6Y1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAMTA1Q9Y6Y1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAMTA1Q9Y6Y1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAMTA1Q9Y6Y1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAMTA1Q9Y6Y1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAMTA1Q9Y6Y1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAMTA1Q9Y6Y1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAMTA1Q9Y6Y1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAMTA1Q9Y6Y1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAMTA1Q9Y6Y1 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAMTA1Q9Y6Y1 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAMTA1Q9Y6Y1 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAMTA1Q9Y6Y1 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAMTA1Q9Y6Y1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAMTA1Q9Y6Y1 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAMTA1Q9Y6Y1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAMTA1Q9Y6Y1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAMTA1Q9Y6Y1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CAMTA1Q9Y6Y1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CAMTA1Q9Y6Y1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CAMTA1Q9Y6Y1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAMTA1Q9Y6Y1 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAMTA1Q9Y6Y1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAMTA1Q9Y6Y1 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAMTA1Q9Y6Y1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAMTA1Q9Y6Y1 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAMTA1Q9Y6Y1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAMTA1Q9Y6Y1 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAMTA1Q9Y6Y1 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CAMTA1Q9Y6Y1 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAMTA1Q9Y6Y1 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAMTA1Q9Y6Y1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAMTA1Q9Y6Y1 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAMTA1Q9Y6Y1 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAMTA1Q9Y6Y1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CAMTA1Q9Y6Y1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAMTA1Q9Y6Y1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CAMTA1Q9Y6Y1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAMTA1Q9Y6Y1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAMTA1Q9Y6Y1 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAMTA1Q9Y6Y1 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAMTA1Q9Y6Y1 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAMTA1Q9Y6Y1 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAMTA1Q9Y6Y1 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CAMTA1Q9Y6Y1 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAMTA1Q9Y6Y1 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CAMTA1Q9Y6Y1 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CAMTA1Q9Y6Y1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAMTA1Q9Y6Y1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAMTA1Q9Y6Y1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAMTA1Q9Y6Y1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAMTA1Q9Y6Y1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAMTA1Q9Y6Y1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAMTA1Q9Y6Y1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAMTA1Q9Y6Y1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAMTA1Q9Y6Y1 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAMTA1Q9Y6Y1 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAMTA1Q9Y6Y1 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms