Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAN1Q9Y2M0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FAN1Q9Y2M0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FAN1Q9Y2M0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FAN1Q9Y2M0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms