Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NUDCQ9Y266 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NUDCQ9Y266 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms