Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNNQ9UQP3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms