Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
SMC3Q9UQE7 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMC3Q9UQE7 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms