Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMCC3Q9ULS5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.2 ms