Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL16

CFAP45, Cilia- and flagella-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP45Q9UL16 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CFAP45Q9UL16 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP45Q9UL16 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP45Q9UL16 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP45Q9UL16 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP45Q9UL16 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP45Q9UL16 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP45Q9UL16 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP45Q9UL16 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP45Q9UL16 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP45Q9UL16 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP45Q9UL16 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP45Q9UL16 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP45Q9UL16 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP45Q9UL16 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP45Q9UL16 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP45Q9UL16 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP45Q9UL16 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP45Q9UL16 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP45Q9UL16 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP45Q9UL16 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CFAP45Q9UL16 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP45Q9UL16 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP45Q9UL16 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP45Q9UL16 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP45Q9UL16 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP45Q9UL16 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP45Q9UL16 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP45Q9UL16 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP45Q9UL16 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP45Q9UL16 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP45Q9UL16 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP45Q9UL16 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP45Q9UL16 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP45Q9UL16 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP45Q9UL16 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP45Q9UL16 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP45Q9UL16 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP45Q9UL16 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP45Q9UL16 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP45Q9UL16 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP45Q9UL16 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP45Q9UL16 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CFAP45Q9UL16 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP45Q9UL16 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP45Q9UL16 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP45Q9UL16 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP45Q9UL16 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP45Q9UL16 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP45Q9UL16 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP45Q9UL16 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP45Q9UL16 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP45Q9UL16 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP45Q9UL16 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP45Q9UL16 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP45Q9UL16 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP45Q9UL16 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP45Q9UL16 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP45Q9UL16 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP45Q9UL16 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP45Q9UL16 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP45Q9UL16 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CFAP45Q9UL16 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms